Los cilios y los flagelos son expansiones de la membrana celular que presentan una estructura similar al centriolo formados por nueve grupos de microtúbulos dobles dispuestos en forma de círculo. Todo este conjuntos se encuentra rodeado de una membrana citoplasmática. Los microtúbulos de los cilios y flagelos están formados básicamente por proteínas.
Se trata de estructuras móviles en forma de látigo. Los cilios son cortos y numerosos mientras que los flagelos son pocos y largos. Tienen funciones locomotoras, nutricias, provocando remolinos que atraen el alimento, o sensoriales.
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